[VIP第1年] 指数:3
一种是用beta巯基乙醇打开蛋白质分子二硫键的，另一种是用DTT(二硫苏糖醇)。两者的作用是一样的，但特点不一样，前者更容易与氧气反应，稳定性比后者差，如果在常温下暴露在空中，前者只能维持24小时的活性，后者却可以维持7天左右。所以该如何选择?如果是蛋白样品较少，跑几次就可以用完的样品，这时选择beta巯基乙醇。如果样品很多，计划跑上几十次的，优先选择DTT,建议变性后分装保存。二、SDS-PAGE凝胶配制1、配胶前准备首先强调一下，一块好的胶是跑好蛋白的前提，所以这个环节也不容忽视。玻璃板的选择，一种是1毫米厚度的，另一种是，这个厚度选择也是有讲究的，如果上样体积小于10微升，优先选1毫米，否则选。原因是什么?答案在转膜部分揭晓。还有分离胶的浓度也要选择适合的。然后玻璃板和梳子要洗干净，晾干。装板，注意厚板和薄板的底部要对齐，否则会漏胶。加制胶的各成分前，要观察液体是否有沉淀，有沉淀的尽量不要用。2、制胶按配方说明依次加入各组分，加完SDS后先简单手动摇匀几下，然后迅速加入过硫酸铵和TEMED,摇匀，紧接着就灌胶。然后我习惯用95%的酒精压胶，我也用过纯水，感觉纯水压没那么好，由于水的密度较大，会把分界处的胶压得膨大。将Transwell小室放入配套培养板中，形成由细胞可穿透性膜分隔开的两室系统，将高营养液与低营养液分隔开。上海裸鼠科研技术服务外包
1.首要原则：细胞不重要情况下立即丢弃，培养箱灭菌，所用培养基也都要丢弃，器械等重新灭菌或拆用新的。2.细菌污染一般都救不回来了，发现的时候培养基一般都很浑浊且细胞都死了3.污染且细胞很重要时：遇到念球菌污染，且细胞为基因改造细胞，非常重要。如231贴壁乳腺细胞，发现细胞周围出现很小的串珠透亮圆点，非常像念球菌污染，此时细胞状态尚可，且污染少。处理如下：用预热或室温PBS清洗3次，可适当振摇，将污染冲洗下来。随后加入10-20%双抗到培养瓶，置于37度培养箱1h，之后再用PBS清洗三遍，直至视野下无可见污染。此时细胞也被冲下大部分，因此此方法只适用在细胞贴壁强，状态好，密度高时使用。之后每天再更换培养基，每次用PBS冲洗2遍。过几天细胞状态尚可时，消化离心时用500r，3min，去掉上清，重复3次。这个方法是根据文献可利用念球菌和细胞体积重量差异实现分离。基本上这一步做完以后，污染就基本了，接下来就注意多观察，勤换液就行。上海组织科研技术服务分离在疫苗测试中，动物模型则可以用来评估疫苗的有效性和安全性。
把膜先用TBST泡洗两遍再用5%脱脂奶粉或者BSA室温封闭1-2小时。注意一定要让蛋白面充分接触封闭液。2、孵一抗脱脂奶粉封闭的话，要用TBST泡洗三遍再转移至一抗溶液中，BSA封闭的可以直接转移至一抗中。如果膜的宽(膜是一个长方形，这里的宽与长相对应)不大于8毫米，我习惯置于15毫升离心管中孵育，两条膜"背对背"式放置于一个管子里(3毫升液体即可)。如果大于8毫米，就用普通的5格的一抗孵育盒(4毫升即可)。4度过夜，一般是12-18个小时，注意放置水平，用摇床。内参等蛋白丰度很高的如果孵久了可能出现条带连在一起的情况，这时可以缩短孵育时间或者降低一抗的浓度。六、孵二抗显影1、孵二抗室温一个小时足矣。这步要注意的是建议用5%BSA或者脱脂奶粉稀释二抗，这样背景会干净许多。也要注意膜的蛋白面要充分接触二抗溶液，我们一般一条膜一个槽地孵。2、显影这一步有个细节可能有些同学没注意到，就是ECL发光液要与HRP反应一分钟后显影效果才会更好，还有要注意的是显影液要均匀覆盖，一般第二次显影(加新的显影液)比一次好看。
是整体甲基化进程所必须的[2]。FTO是ALKB家族的成员，作为个被发现的去甲基酶，可影响剪切因子SRSF2的RNA结合能力，进而调控pre-mRNA的剪切加工过程[3]。目前已发现FTO调节异常与肥胖、大脑畸形和生长迟缓相关，揭示m6A可能对这些疾病具有重要的调节功能[4-6]。ALKBH5是ALKB家族中被发现具有去甲基作用的另一个成员，以RNaseA敏感的方式与核小斑共定位，它可直接催化m6A-甲基化腺苷去除甲基而不同于FTO的氧化去甲基化[7].此外，ALKBH5和它的去甲基化活性影响新生mRNA合的成和剪切效率[7]，且ALKBH5敲除雄性小鼠表现出精子发生异常，这可能是精子发生相关基因表达改变的结果[7]。m6AmRNA修饰执行其功能主要通过两个途径：精细调控甲基化转录本的结构，以阻止或诱使蛋白-RNA相互作用；或被直接由m6A结合蛋白识别，诱发续反应。目前一类含有YTH功能结构域的蛋白被鉴定为m6A修饰的结合蛋白。其中YTHDF1,YTHDF2,YTHDF3，YTHDC1和YTHDC2己被证实是ｍ６Ａ的结合蛋白.YTHDF1主要影响ｍ６Ａ修饰基因的翻译，YTHDF2主要影响ｍ６Ａ修饰基因的降解，而YTHDC1结合ｍ６Ａ修饰的基因影响其剪接。HNRNPC是一种丰富的核RNA结合蛋白，参与pre-mRNA的加工[8]。随着跨学科研究的深入开展，动物疾病模型将在未来发挥更为普遍的作用，成为生命科学、医学等领域研究工具。
我们知道WB实验步骤繁琐，一次实验历时也不短，从提蛋白到显影结束可能要三天，我们就讲一下这里面的一些关键环节。一、蛋白提取及变性1、提取蛋白很多经验丰富的WB实验者都深有体会，蛋白提取是影响结重要的环节之一。该过程重要的是防降解和保证蛋白浓度不要太低。防降解主要有两点，一是裂解前注意保持样品处于低温环境中，二是裂解时加入足够的蛋白酶抑制剂。我们习惯先用冰冷的PBS做心脏的体循环灌注，然后冰上取脑，分离各脑区(嗅球，皮层，海马，中脑，小脑，延髓，丘脑，纹状体)后置于，用液氮速冻后转移至-80度冰箱长期保存。接着是保证蛋白浓度，即要加入适量的裂解液，加太少会使蛋白提取不充分，加太多会让蛋白浓度太低，一般经验是这样的，细胞样品例如一个六孔板的细胞加60微升的裂解液，动物组织的话每毫克组织加10微升裂解液。还要加上超声破碎处理，具体方案见讨论部分。如果没有超声破碎仪，那就用1毫升注射器不断抽吸，冰上反复抽吸1分钟左右，注意不要产生过多气泡。(需要灌注取材的视频可以私聊获取，由于文件过大，又比较血腥，不宜直接放到文章里。)2、蛋白变性加入上样缓冲液后100摄氏度煮10分钟，这里的上样缓冲液有两种可选。饲养动物及干预 动物购买后需要将时间节点提前规划好。上海组织科研技术服务购买
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实验样本分类实验一般采取样本有：血液样本、样本和细胞样本。通常，样本采集后，应立即用等渗溶液（PBS或生理盐水）尽量把血液漂洗干净（除非血液也是分析对象），用滤纸或纱布吸干，把样本分切成几分，每份的体积约2个黄豆大小，每份用一个管子装。血液样本的采集应根据不同实验的要求，将会采取不同策略。血清样本：全血中不加抗凝剂，血液凝固后取出的不含凝血因子的淡黄色透明液体。（全血标本室温放置2小时3000rpm/min离心15min）血浆样本：全血中加抗凝剂，血液凝固后取出的含凝血因子的淡黄色透明液体。（可用EDTA或肝素作为抗凝剂，标本采集后30分钟内于2-8℃，3000rpm/min离心15min）如果是做生化\ELISA等检测可以考虑血浆和血清，根据获得的样本量可考虑分装成100-500μl/管，可避免反复冻融造成的检测误差。生化：建议优先选择血清，其次选择肝素抗凝血浆；ELISA：建议优先选择血清，其次选择肝素或EDTA抗凝血浆；凝血实验：只能选择枸橼酸钠抗凝血浆；血常规：只能选择EDTA抗凝全血；如果要收集其中的白细胞、血小板等建议用抗凝全血。如果要做流式建议用专门的流式用血液收集管，防止表面抗原的丢失，或者尽快安排就近检测。样本处理取样完后。上海裸鼠科研技术服务外包
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