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菌群移植移植途径的选择：推荐在行FMT前评估消化道动力（1D）消化道动力影响菌液在消化道中的停留时间。另一方面，对于消化道动力差的患者，如一次性输注过多菌液，则极有可能引起或加重恶心、呕吐、腹胀、肚子疼等不良反应，故在行FMT前需评估消化道动力，并作为确定FMT路径与单次输注菌液体积的参考。例如，存在胃排空障碍的患者，不宜采用口服或鼻胃管路径；肠道动力缓慢的患者，应适当减少一次性输注菌液的量或减慢输注速度。消化道动力评估首先应询问病史，对于明显存在肠道动力紊乱的患者，可采用口服钡剂或小肠插管碘水造影法，既能动态观察消化道蠕动状况、又能观察消化道有无形态结构异常。不建议进行结肠传输试验，因为它耗时久、且不利于动态观察，意义不大！菌群移植的疗效与植入菌群的多样性、活性密切相关，如何维持其在受体肠道的长期定植仍是研究重点。上海直肠菌群移植临床应用
菌群移植过程中选择智能化配型选择服务（菌群移植3.0时代的标志）。基于16srDNA检测的智能化供-受体配型选择，为全国各地合作机构提供FMT诊疗患者提供优势供体菌液配型的个性化解决方案，以实现FMT的疗效。上海沃本生物科技有限公司作为菌群移植行业的先行者，具有相关知识产权，与同济大学上海自主智能无人系统科学中心、同济大学生命科学与技术学院生物信息系教授联合开展了深入的临床转化及产业合作。联合申报了2021世界人工智能大会云端峰会，角逐世界人工智能大会的比较高奖项，SuperAILeader，简称SAIL奖!上海粪便菌群移植**共识肠道菌群移植在代谢性脂肪性肝病中的应用。
早在2003年，神经解剖学家Heiko Braak提出假说：帕金森病可能始于肠道。某种病原体通过迷走神经侵入大脑，而α-突触蛋白的异常聚集正是这一过程的“路标”。后续研究佐证了这一猜想——排便困难患者数十年后患病风险更高，而切除阑尾或切断迷走神经的人群风险降低。更关键的是，动物实验显示，无菌环境中的转基因小鼠（易产生α-突触蛋白）运动症状出现更晚；移植帕金森患者的肠道菌群后，小鼠症状甚至加剧。
“即便病理不始于肠道，症状终将蔓延至此。缓解肠道问题本身就有价值，若能延缓疾病进展，更是锦上添花。”
粪菌移植(fecalmicrobiotatransplantation,FMT)作为重建肠道菌群的有效手段，已用于难辨梭状芽孢杆菌(Clostridiumdiffcile)infect等多种菌群相关性疾病的改善和探索性研究，并被认为是近年的突破性医学进展。然而，这不是一项单纯的技术，而是一种体系。如果假设该体系健全，而且假设FMT很终被证明可以用来有效改善特定状态(或特定类型)的难治性肠道infect、难治性炎症性肠病、癫痫病、肝病、tumor合并的肠道疾病、糖尿病合并的神经病变以及自闭症合并的过敏症等(统称肠道菌群相关性疾病)，那么，这在医疗技术类型和学科分类构架中又如何定位FMT呢沃本菌群移植操作规范，收集的粪便迅速冷却处理，菌液制备后低温保存，保证菌群活性。
菌群移植应建立不良反应及处理流程：1.建立不良反应上报制度（2C）2.执行严格的入选和排除标准，FMT诊疗前评估并发症风险（1C）：（1）误吸风险，如高龄、卧床、贲门关闭不全等高风险者禁用鼻肠管途径，给予口服胶囊或结肠镜FMT途径；（2）肠源性风险，如全身及肠黏膜屏障功能严重受损应禁用FMT诊疗（1C）3.症状轻（以头晕、恶心、胃肠道不适等为主诉）的患者，观察即可（1C）4.中度症状对症处理，不能缓解予以暂停FMT诊疗（2D）5.症状严重（由鼻肠管途径导致的咽喉部疼痛、恶心、呕吐等）者，对症处理不能缓解，给予拔除鼻肠管，改口服胶囊、结肠镜或灌肠移植途径（2D）6.症状严重者，暂停或终止FMT诊疗并对症处理；体温≥39℃者需排除肠源性***（2D）7.怀疑肠源性症状时，立即终止FMT诊疗，检测供体和受体粪便致病菌，留取血培养检查，补液等诊疗（1C）8.极重度症状如并发生命体征异常者，立即终止FMT诊疗，同时针对靶诊疗（1C）！菌群移植不仅能改善肠道症状，对孤独症、代谢综合征等肠道外疾病，也因调节肠道菌群发挥积极作用。上海腹泻使用菌群移植成功案例
靶向肠菌改善糖尿病周围神经病变。上海直肠菌群移植临床应用
菌群移植过程中菌液制备标准操作流程（SOP）粪便应在粪菌库的特定一次性容器中现场收集；在粪菌库外收集，应将收集的粪便迅速冷却至4℃，6h内送至粪菌库；在粪便库中接受信息登记、粪便鉴定、称重、评估和处理。处理过程尽量保持在厌氧环境中。菌液制备后放置-80℃冰箱内保存，有效期为6个月。在菌液的使用当天，需放置37℃水浴箱解冻，解冻后的菌液必须在6h内使用完毕。1.菌液应在捐献后6h内，在厌氧环境下完成菌液制备（1A）2.菌液制备后放置-80℃冰箱内保存，有效期为6个月（1A）3.每个供体捐献的粪便除了制备菌液和常规筛查检测以外，必须留一份2ml的菌液保存至少6个月，一旦出现异常具有可追溯性（1C）4.菌液必须注明供体信息代码、捐献日期、生产和出厂日期、有效期、剂量及存储温度等（2C）.上海直肠菌群移植临床应用
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